冬瓜子清肺化痰、消癰排膿、利濕，主要治療痰熱咳嗽、肺癰、白濁、帶下、腳氣、水腫等癥狀。古文中也記載著關于冬瓜子的藥用價值，而現在冬瓜子在醫藥上的地位也是不可否認的。

冬瓜子水提取后，經透析得透析內液，為B細胞致絲裂劑，有無性系B細胞激活劑活性及佐劑活性，可使空斑形成細胞 數數目顯著增高，呈現免疫促進作用。從冬瓜子中分離純化出4個組分，具有抑制胰蛋白酶活力的作用。

冬瓜子所含有的植物油中的亞油酸等物質，是潤澤皮膚的美容劑。不飽和脂肪酸可以使容顏紅潤光澤，皮膚細嫩柔潤，頭發烏黑光亮。其次冬瓜子也可用于暑熱煩渴、肺熱痰多、腎炎水腫、小便不利等。冬瓜子可以排膿祛痰，是治療支氣管擴張、肺膿瘍的重要藥物之一。

看來冬瓜子的藥用價值的確非同凡響，用冬瓜100克，白茅根、赤小豆、玉蜀黍心各適量，同煎服，每日2-3次，用于腎炎小便不通；冬瓜子30克，白果仁10粒，用水一碗半，煮成一碗飲服，治婦女帶下、粘稠腥臭;冬瓜皮、麥冬各60克，天花粉10克，煎服，治糖尿病、小便多；冬瓜皮60克，山藥30克，鯽魚一條，燉爛服用，治腹水、腹脹;冬瓜湯外洗治痔瘡疼痛等。