乙肝疫苗的品種、劑量以及接種點的不同，都能使得注射乙肝疫苗的費用有所偏差。至今我國也沒有對乙肝疫苗的費用做一個統一的標準。

品種上：進口的乙肝疫苗一般都在50元以上，國產的回比較便宜，10-30元。抗體所維持的時間多在3-8年，有些可長達15年。

劑量：同一品種的，10微克每支就20塊錢，20微克每支的40塊錢，以此類推。一些因為錯過了接種時間或者免疫應答低的，需要增加劑量，費用就相對來說會高一些。

接種點：同一地區不同的接種點和不同地區不同接種點的費用都會有所不同。例如一般的防疫站就會比醫院要便宜些；有些地區醫院還會收取注射器和注射費用，有些則是免費。