妊娠合并肺結核的病因主要由兩大類。

第一個就是生物學原理。孕婦懷孕的時候會因為自主神經調節失調體內內分泌及代謝功能紊亂，免疫力也會下降；加上卵巢激素增加，肺呈充血狀態；甲狀腺功能亢進，代謝率增加；血液中膽固醇增高等，都是有利于結核菌在肺里的生長、繁殖的，這樣就為孕婦肺結核發病奠定了基礎。妊娠期孕婦腎上腺皮質激素分泌增多，毛細血管通透性增加，t淋巴活性降低，體內結核菌容易由淋巴系統擴散至血液循環，而引起結核播散，導致孕婦可能會有肺外結核。

第二個是妊娠對肺結核的影響。對于這個病因，很多人有不同的看法，有人認為妊娠對肺結核是有害的，會加劇病情以及導致病情復發，原因是因為妊娠早期出現的惡心、嘔吐、食欲不振等反應，影響了孕婦的進食與營養。同時妊娠期孕婦臟器負擔加重，能量消耗增加，嬰兒缺少營養，孕婦身體機能也下降，病情加重。