除了口感香甜外，南瓜餅的營養價值也很豐富，主要是因為南瓜中的營養成分十分豐富。南瓜富含胡蘿卜素、維生素、葡萄糖、鈣、鐵和淀粉等，其中胡蘿卜素含量為西瓜的8—20倍，是維生素A的優質來源。此外南瓜還含有瓜氨酸、精氨酸、天門冬酸、葫蘆巴堿、南瓜子堿、脂肪、可溶性纖維及甘露醇等營養成分。南瓜果膠含量較高，為南瓜干物質含量的7％—17％，脂肪含量卻較低，約占2％。南瓜的熱量近于小麥、玉米，蛋白質相當于菜豆、洋菜，維生素A的含量相當于番茄，維生素C的含量高于黃瓜。

南瓜除了富含果膠、戊聚糠、甘露醇、多種氨基酸，還含有豐富的β-胡蘿卜素，它會轉變為維生素A，而維生素A和蛋白質結合可形成視蛋白在視覺上扮演重要的角色。一旦寶寶缺乏胡蘿卜素會導致夜盲甚至全盲的嚴重后果。但要注意不可使用過量，否則寶貝就會變成“黃皮”寶貝。南瓜中鈷的含量較高，是其他任何蔬菜都不可相比的，它是胰島細胞合成胰島素所必需的微量元素，因此常吃南瓜有助于防治糖尿病。