南瓜子有很好的殺滅人體內寄生蟲（如蟯蟲、鉤蟲等）的作用。對血吸蟲也具有很好的殺滅作用，是血吸蟲病的首選食療之品。美國研究發現，每天吃上50克左右的南瓜子，可較為有效地防治前列腺疾病。這是由于前列腺的分泌激素功能要依靠脂肪酸，而南瓜子就富含脂肪酸，可使前列腺保持良好功能。所含的活性成分可消除前列腺炎初期的腫脹，同時還有預防前列腺癌的作用。南瓜子含有豐富的泛酸，這種物質可以緩解靜止性心絞痛，并有降壓的作用。

南瓜子含有豐富的氨基酸、不飽和脂肪酸、維生素及胡蘿卜素等營養成分。經常吃南瓜子不但可預防腎結石的發生，還可促進已有結石的排出。更重要的是，南瓜子中的活性成分和豐富的鋅元素，對前列腺有保健作用。每天堅持吃一把南瓜子，可防治前列腺肥大。南瓜子含有豐富的磷，磷對男性前列腺也有好處，一些前列腺疾病就是因為缺磷造成的。