艾蒿一直被醫生作為一種藥材使用，用來治療很多種病癥。艾蒿水主要是用艾蒿煎煮的水，所以艾蒿水也擁有艾蒿的作用，艾蒿水主要發揮的作用包括：

1、具有抗菌及抗病毒的作用。干枯后的株體泡水熏蒸以達消毒止癢，產婦多用艾水洗澡或熏蒸。此外，艾蒿還可以增強人體對疾病的抵抗能力。

2、能夠驅寒止血。艾蒿是一種性溫之物，并且本身帶有苦味。可以起到溫經、去濕、散寒、止血、消炎、平喘、止咳、安胎、抗過敏等作用。

3、具有鎮靜功能和護肝利膽的作用。艾蒿做成的“艾蒿湯”、“艾蒿水”等，可以起到護肝利膽的作用。用艾蒿泡腳還可以疏通經絡，對肝膽也有好處。

4、可驅趕蚊蟲。艾蒿里面含有一種特別的香味，這種香味可以起到驅趕蚊蟲的作用。在皮膚上抹上艾蒿水，蚊蟲就不敢靠近了。